由于没有汽包，直流蒸汽锅炉中的水容量及响应的蓄热能力比汽包锅炉大为降低，一般只为同参数汽包锅炉的50%以下，因此，直流锅炉对负荷变化比较敏感，锅炉工作压力也变化得比较快。如果燃料、给水等比例失调，就会严重影响锅炉的处理及蒸汽参数，这就要求直流锅炉又更灵敏可靠的调节控制手段。
直流蒸汽锅炉一般不能连续排污，给水带入锅炉的盐类，除由蒸汽带走一部分外，其余都将沉积在受热面管子中，为了保证工作可靠，所以直流锅炉对给水品质的要求很高。
在直流锅炉蒸汽受热面中会出现流动不稳定、脉动等问题，会直接影响锅炉的安全运行。
在直流锅炉中，蒸发受热面中的水冲开水汽化一直到完全汽化，都是在高压、高含气率的条件下进行的，锅炉蒸发受热面管内的换热有可能出于膜态沸腾状态，受热面的金属壁温就会急剧升高，容易过热损坏。因此，防止膜态沸腾是直流锅炉设计和运行中必须注意的问题。
由于没有厚壁的汽包，直流蒸汽锅炉在启、停过程中，各部件的加热和冷却都容易达到均匀，所以启动和停炉都比较快。冷炉点火后约40~50min就可供额定压力和温度的蒸汽，而自然循环锅炉则大约需要2~4h。
在启动过程中，要有专门的系统，以便有足够的水量通过蒸发受热面，以保护它不至于被烧坏。
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